第1作『ペガロク　ふるさとにかえる』の好評にお答えして、前作のスタッフ・キャストが再結集して制作したプラネタリウム用オリジナルアニメーション作品です。

満月の夜、まあちゃん、たーくん姉弟がペガロクと楽しくお話していると、ペガロクの幼なじみペガミちゃんがあらわれました。
ペガミちゃんのふるさとタマゴ星が、宇宙の食いしん坊怪獣「まっくろあな」に飲み込まれそうなのです。
ペガロクたちはタマゴ星を救うため、ふたたびクジラに乗って宇宙へ旅立ちました。ペガロクたちはタマゴ星を救うことが出来るのでしょうか！？